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La técnica de edición genética Crispr también empieza a ser útil para detectar virus como el SARS-CoV-2. En concreto, un equipo del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), y la Universidad de Valencia (UV) ha desarrollado un método para detectar este tipo de virus.
Así, se pueden detectar varias regiones del mismo virus y también de diferentes tipos de coronavirus. Y con la ventaja de la rapidez de diagnóstico de los test de antígenos y la precisión de las técnicas PCR. Además, la versatilidad de este método, que permite detectar otros virus e incluso biomarcadores genéticos humanos, ha llevado al CSIC y la UV a presentar una solicitud de patente europea para proteger este método.
Es un nuevo método de detección de ácidos nucleicos basado en la proteína Cas9, que proviene de lo que se considera el sistema inmune bacteriano
Se trata de un nuevo método de detección de ácidos nucleicos basado en la proteína Cas9, que proviene de lo que se considera el sistema inmune bacteriano. Crispr es el nombre de unas familias de secuencias de ADN presentes en bacterias que contienen fragmentos genéticos de virus. Estos los utiliza la bacteria para detectar virus similares y destruirlos. Estas secuencias son la base de la técnica conocida como Crispr/Cas9, que utiliza unas guías de ARN y la proteína Cas9 para dirigirse a zonas elegidas del ADN y cortarlas.
“La proteína Cas9 encuentra su diana en el ADN gracias a una molécula guía que la acompaña. Después, corta la secuencia diana y desplaza un fragmento de ADN que puede interaccionar con una molécula reportera emitiendo una señal de fluorescencia que podemos medir”, explica Rosa Márquez-Costa, investigadora predoctoral del I2SysBio.
Detección multiplexada de diferentes secuencias
Por otro lado, los investigadores comprobaron el potencial de esta técnica para detectar el virus del SARS-CoV-2 en muestras clínicas. Así, Crispr/Cas9 permite la detección multiplexada de diferentes secuencias. De modo que, para cada una de ellas, puede diseñarse una secuencia guía y una molécula reportera específicas. Además, los sistemas Crispr permiten discriminar con gran resolución secuencias genéticas (obteniendo la precisión de una PCR) y se pueden acoplar a métodos rápidos de amplificación isotérmica (con la rapidez de un test de antígenos).
Márquez-Costa: “Nuestro sistema se basa en reconfiguraciones moleculares que permiten detectar en una misma reacción diferentes secuencias”
“Existen otras técnicas de detección con sistemas Crispr, pero hacen uso de una actividad enzimática de corte inespecífica, lo que limita la detección multiplexada. Nuestro sistema no se basa en el corte de cadenas de ácidos nucleicos, sino en reconfiguraciones moleculares que se producen gracias a interacciones específicas, pudiendo así detectar en una misma reacción diferentes secuencias”, añade Márquez-Costa.
El equipo del I2SysBio, dirigido por el investigador Guillermo Rodrigo, destaca que el sistema tiene una gran plasticidad que permitiría emplearlo en la detección de una gran variedad de elementos; desde otro tipo de infecciones con virus distintos hasta mutaciones o biomarcadores en el propio ser humano.
