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Este martes se conmemora el Día Mundial de la Lucha contra el Sida y todavía quedan muchos aspectos por resolver sobre el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). Por ejemplo, sobre las variantes de VIH-1 que siguen circulando. Este ha sido el objeto de estudio de la investigación más completa realizada hasta la fecha sobre las variantes de VIH-1 que circulan entre niños, adolescentes y adultos en Kinshasa, en la República Democrática del Congo (RDC). Esta zona está considerada como el origen de la pandemia del Sida. El estudio, publicado en Scientific Reports, lo lidera la investigadora África Holguín, del Hospital Ramón y Cajal de Madrid y del CIBER de Epidemiología y Salud Pública (Ciberesp).
Los investigadores analizaron la diversidad de variantes del VIH-1 en 2.806 niños, adolescentes y adultos con VIH en este país africano mediante reconstrucciones filogenéticas. Para ello, realizaron análisis bioinformáticos en todas las secuencias de virus en la región codificante de las principales dianas terapéuticas (región viral pol) disponibles en personas infectadas en RDC. Esto incluía nuevas secuencias virales generadas a partir de nuevas muestras de sangre seca tomadas de 165 personas infectadas en Kinshasa entre 2016 y 2018.
El trabajo aporta los datos más recientes de las variantes del VIH-1 en RDC y sus tendencias temporales desde la primera secuencia disponible
Así, el trabajo aporta los datos más recientes de las variantes del VIH-1 en RDC y sus tendencias temporales desde la primera secuencia disponible en el país tomada en una muestra recuperada en 1976 hasta la última en 2018. Así como en Kinshasa, su capital, de 1983 a 2018. También se analizaron eventos de recombinación y se identificaron grupos de transmisión reciente en la cohorte de estudio.
“Los estudios de vigilancia de la epidemiología molecular del VIH-1 son importantes a nivel mundial y de interés en cualquier entorno. Pero son aún más interesantes en un área con una alta diversidad viral, origen de la pandemia de VIH-1; donde el virus ha estado circulando durante más tiempo y podrían surgir nuevas variantes más patógenas o transmisibles”, detalla la investigadora África Holguín.
Más de 133 variedades descritas
En la actualidad se han descrito más de 133 variantes del VIH en base a su homología genética. Estas variantes se dividen en tipos, grupos, subtipos, sub-subtipos, y recombinantes circulantes (CRF) y únicos (URF). Por eso el trabajo se centró en estudiar la distribución temporal de cada una de las variantes del VIH-1 en el gen pol. Así como la diversidad genética viral en el país y en Kinshasa desde el principio de la pandemia hasta la actualidad.
Se compararon las variantes virales en las 165 nuevas secuencias generadas con las variantes reclasificadas a partir de todas las 2.641 secuencias pol depositadas en la base de datos de Los Álamos
Para lograrlo, se compararon las variantes virales en las 165 nuevas secuencias generadas con las variantes reclasificadas a partir de todas las 2.641 secuencias pol depositadas en la base de datos de Los Álamos por otros autores hasta la fecha de estudio. Estas últimas se tomaron en muestras de pacientes con VIH de RDC durante 1976-2012 y en Kinshasa durante 1983-2008.
Por otro lado, se reclasificaron previamente las variantes virales en todas las secuencias del VIH depositadas en la base de datos de Los Álamos antes de 2016 con nuevos análisis filogenéticos para incluir las nuevas variantes del VIH-1 identificadas en los años más recientes.
A, G y C, los subtipos que más circulan
Durante el periodo 2016-2018 los principales subtipos que circulaban en el país fueron el A (26,7%), G (9,7%) y C (7,3%). Los recombinantes entre subtipos representaron un tercio de las infecciones, siendo el 12,7% CRF y 23,6% URF (recombinantes más complejos). Se identificó el primer recombinante CRF47_BF informado en África y cuatro grupos de transmisión, 3 de ellos recientes. Asimismo, se observó un aumento significativo del subtipo A y del subtipo F1 en Kinshasa durante 2016-2018, así como una reducción significativa del sub-subtipo A1 y del subtipo D, en comparación con las variantes que circulaban en esa ciudad de 1983 a 2008.
África Holguín: “Nuestro estudio refuerza el uso de sangre seca como un tipo de muestra útil y alternativa a la sangre entera o plasma”
Holguín señala que “proporcionamos información única y actualizada sobre la epidemiología molecular del VIH-1 en RDC y sobre las variantes del VIH-1 que circulan actualmente en Kinshasa”. Asimismo, presenta una revisión completa de las tendencias temporales de los subtipos, y recombinantes CRF y URF en ese país durante 43 años. De modo que se proporcionan los datos más amplios sobre niños y adolescentes en toda la historia de la epidemia en el país.
La investigadora del Ciberesp concluye que “nuestro estudio refuerza el uso de sangre seca como un tipo de muestra útil y alternativa a la sangre entera o plasma en estudios de vigilancia epidemiológica molecular del VIH en países o entornos con limitaciones para la toma, almacenamiento o transporte de sangre”.
En el proyecto han participado investigadores del Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH del Instituto de Investigación Sanitaria (Irycis), adscrito al Servicio de Microbiología en el Hospital Ramón y Cajal de Madrid. También ha colaborado el grupo de Juan Carlos Galán (Ciberesp), del Laboratorio de Virología del mismo Servicio hospitalario; la Clínica Universidad de Navarra y el Hospital de Monkole en Kinshasa. Esta investigación se engloba dentro del programa Inmigración y Salud del CIiberesp, en el que participan Holguín y Galán.
