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Hasta el momento, las pruebas rápidas de PCR para detectar el SARS-CoV-2 no distinguían entre virus infecciosos e inactivados. Ahora, un equipo de investigadores del Instituto de Agroquímica y Tecnología de los Alimentos (IATA-CSIC), del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) ha desarrollado un sistema que permite eliminar la señal de PCR de los virus inactivos. Para lograrlo, utilizaron un marcador molecular de viabilidad que se puede emplear en cualquier laboratorio convencional. Así, se mejora la fiabilidad de esta prueba para detectar el coronavirus infeccioso en muestras clínicas y medioambientales.
Se trata de un tratamiento de las muestras usadas para realizar la PCR rápida mediante un reactivo de viabilidad, cloruro de platino, que penetra a través de la membrana del virus inactivo. De esta forma, se une a su material genético impidiendo su detección en la prueba diagnóstica. Así se consigue que la PCR detecte sólo el virus potencialmente infeccioso. El método está descrito tanto para muestras clínicas de pacientes con coronavirus como en aguas residuales en la revista Scientific Reports, del grupo Nature.
Se trata de un tratamiento de las muestras usadas para realizar la PCR rápida mediante un reactivo de viabilidad que penetra a través de la membrana del virus inactivo
En concreto, los investigadores utilizaron muestras inactivadas de SARS-CoV-2 para evaluar cinco compuestos como reactivos de viabilidad y así optimizar el procedimiento. Según explica Gloria Sánchez, investigadora del CSIC responsable del grupo de Virología Ambiental y Seguridad Alimentaria (VISAFELab) del IATA-CSIC, “el objetivo era quitar la señal de la PCR que se corresponde a virus no infecciosos. De manera que, utilizando distintos compuestos y matrices para tratar las muestras, logramos las condiciones óptimas para no detectar el coronavirus inactivado en las PCR”.
Evitar los ‘falsos positivos’ en las PCR rápidas
Por otro lado, para validar el sistema se emplearon muestras de pacientes con coronavirus facilitadas por el Servicio de Microbiología del Hospital Clínico de Valencia-Instituto de Investigación Sanitaria (Incliva); así como muestras de aguas residuales, donde se estudia desde el inicio de la pandemia la presencia del coronavirus como indicador de su evolución.
Este método desarrollado por el CSIC evitaría el problema de las PCR positivas, cuando lo que se detecta es un virus no infeccioso
De hecho, el grupo del IATA-CSIC analiza mediante pruebas de PCR rápidas las aguas residuales de varias ciudades españolas para rastrear la presencia del coronavirus. “Con este nuevo método hemos demostrado que las aguas residuales no son un vector de transmisión del coronavirus, puesto que el virus que detectamos está inactivado”, revela Walter Randazzo, investigador posdoctoral del grupo.
En cuanto a las muestras clínicas, este método evitaría el problema de las PCR positivas, cuando lo que se detecta es un virus no infeccioso. Además, la forma de preparar las muestras se puede realizar en cualquier laboratorio que haga PCR.
Además, este grupo investigador realizó otro estudio donde aplican este método a muestras de coronavirus recogidas de diversas superficies. Los resultados, publicados en Environmental Research, “muestran que el sistema es eficaz para recuperar el SARS-CoV-2 y otros coronavirus en las superficies. Además, elimina también la señal de PCR de virus inactivos”, destaca Gloria Sánchez.
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